近几年来，黑木耳工程技术中心科研成果丰硕，中心的的老师们申请成功了很多科研项目：刘向东老师申请了国家自然科学基金项目《巴旦木脱青皮机理分析及实验研究》、自治区科技厅基金项目《阿克苏黑木耳菌种资源培育推广共享平台》、阿克苏地区科技局项目《万亩亿元增收工程技术中心建设》以及农业部项目《南疆杏加工关键技术装备集成与试验示范》；裴龙英老师申报了自治区教育厅基金项目《适于阿克苏地区气候的黑木耳生产技术研究》；布海丽且姆·阿卜杜热合曼老师申报了自治区科技厅青年项目《适用于阿克苏地区的黑木耳及液体菌种培养工艺研究》，也为中心引进了不少科研设备和优秀人才。